然后卖给与自己公司合作的运输车辆是否违法

根据我国相关法律规定，贩卖柴油是犯法行为。贩卖柴油必须有行政许可，有了营业执照才可以买卖，如果没有许可证，私人买卖汽油柴油是违法的。买卖的数量较大，涉嫌构成非法经营罪。法律依据：《刑法》第二百二十五条违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：（一）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；（二）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；（三）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的；（四）其他严重扰乱市场秩序的非法经营行为。
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